文章の途中に数式を入れる時は align=middle とするとよい、というようにあちこちに書かれているのですが、このはてなに関してだけかもしれませんが、むしろ alignをつけない方がうまく書けるような気がしていままでつけてきませんでした。
たとえばこんな感じ です。
<img src="http://www.forkosh.com/mathtex.cgi?c=\sqrt{a^2+b^2}">
htmlの説明を読んでいたら、align には top, bottom, center, middle, absmiddle があって、いろいろ試したところ、absmiddleは使えそうです。
こんな感じ です。
<img src="http://www.forkosh.com/mathtex.cgi?f(x)=\int_{-\infty}^xe^{-t^2}dt" align=absmiddle>
これを align=absmiddle を取ると となります。